Sequenom MassARRAY® DNA 甲基化分析定制服务
MassARRAY®EpiTYPER™ DNA 甲基化分析技术结合了碱基特异性酶切反应和 MALDI-TOF 检测原理用于DNA 甲基化定量分析。可实现多重 CpG 的分析检测，是用于 DNA 甲基化定量分析及在基因组任何区域或者候选基因中鉴定甲基化定量分析的首选方法。
碱基特异性酶切（MassCLEAVE）实验由亚硫酸盐处理待测 DNA 开始。经过亚硫酸盐处理，DNA中的未甲基化的胞嘧啶 (C) 转变为尿嘧啶（U）,由此在 DNA 模板中产生甲基化特异的序列变化。利用 5' 末端带有T7-启动子的引物进行 PCR 扩增，产物经 SAP (虾碱性磷酸酶)处理后用于碱基特异性的酶切反应。酶切后 DNA 片段的大小和分子量取决于亚硫酸盐处理后的碱基变化，飞行质谱能测出每个片段的分子量，配套软件 EpiTYPER 则能自动报告每个相应片段的甲基化程度。
服务流程
★ 客户提供 DNA 或者生物样本
★ 样本前处理
★ PCR 扩增、SAP、Transcription、Cleavage
★ 点样
★ 质谱检测
★ 分析报告
技术特点
★ 高性能
● 能够分析覆盖长达 600bp 的多个 CpG 位点
● 能够分析福尔马林处理的石蜡组织
● 无需任何荧光标记
★ 高灵敏度
● 精度高（5%CV）
● 检测低至 5% 的甲基化水平
● 分析需要的起始样本量少（<5pg）
★ 高性价比
● 用384孔板进行 PCR 反应
● 一个扩增产物可以进行多重 CpG位点分析
● 无需后续验证，可直接发表结果
★ 操作简便
● 无需设计 CpG 位点特异性引物
● 无需进行 PCR 产物纯化
● 研究几个到几百个甲基化位点的理想手段
参考文献
★ HEIJMANS, B., et al. (2007) “Heritable rather than age-related environmental and stochastic factors dominate variation in DNA methylation of the human 1GF2/H19 locus” Hum Mol Genet 16(5):547-54.
★ RAVAL, A., et al. (2007). “Downregulation of Death-Associated Protein Kinase 1(DAPK1) in chronic lymphocytic leukemia.” Cell 129: 879-90.
★ RICHTER, E., et al. (2007). “A role for DNA methylation in regulating the growth suppressor PMEPA1 gene in prostate cancer.” Epigenetics 2(2):100-105.
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290050
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