NimbleGen DNA甲基化芯片检测服务

简　介
     基因组DNA甲基化修饰是目前表现遗传学研究的重点内容。罗氏NimbleGen提供全基因组甲基化检测芯片、启动子甲基化芯片和定制的甲基化芯片。在检测上采用甲基化DNA免疫沉淀方法（Methylated DNA Immunoprecipitation, MeDIP），即使用甲基化胞嘧啶特异的抗体对甲基化DNA进行富集后，进行标记和杂交，该过程操作简便，可靠性高。罗氏NimbleGen丰富而多样化的产品为基础生物学以及肿瘤和其他疾病的表现遗传学机制研究，直至寻找大规模的甲基化表观遗传学标志物提供了高效的技术平台。
 

技术特点
 高密度探针，高分辨率检测：针对人、大鼠和小鼠三个物种设计的2.1M全基因组叠瓦式芯片（Whole Gemone Tiling），使用10张2.1M芯片，以100bp的间隔（或者4张芯片以200bp左右的间隔）便实现全部非重复区基因组覆盖；仅以1张针对人和小鼠已知基因启动子的2.1M Deluxe启动子芯片，单张芯片便能以100bp的探针间隔覆盖人或小鼠已注释的启动子、已注释的CpG岛、miRNA基因启动子、或人为选择的编码区基因；定制芯片可以在更高分辨率下实现对基因组覆盖。
 高灵敏度和高特异性：通过对长度在50-75mer探针Tm值的优化设计，具有极高灵敏度和特异性；双通道杂交可以有效消减芯片间的差异，提高芯片重复性，能够可靠地检测出每500bp片段内2个甲基化CpG。CpG与增强子芯片包含印记基因（如H19/IGF2）和深度甲基化的HoxA基因群，可以作为阳性对照区监控实验结果。
 覆盖多个物种的芯片，多种芯片规格：覆盖人，小鼠，大鼠，鸡，狗，蚯蚓，果蝇和部分植物的全基因组芯片；针对人和小鼠生物学上重要的基因组区域，提供针对启动子和/或CpG岛的甲基化芯片；或者根据客户设计的探针来定制芯片。
 最新的芯片设计：使用最新的基因组和序列注释信息，确保全面而及时的基因组信息更新。也可以根据原本的基因组数据获取芯片设计，方便与原来的研究结果进行对比。
 

检测原理
 
 

典型应用
 对肿瘤、遗传性疾病的研究，可选择针对全基因组、启动子或CpG岛设计的芯片，也可以定制设计以更贴切地满足各种具体需要。
 启动子区甲基化对基因的调控研究
 比较不同组织、细胞的甲基化图谱，发现甲基化修饰模式
 寻找诊断和预后相关的甲基化修饰标志