晶芯®转录因子活性谱芯片技术服务
转录因子是细胞内一类重要的基因表达调控蛋白，它通过与基因上游启动子区中特异的DNA序列的相互作用，来决定被调控基因的开启和关闭以及表达量。一个转录因子可调控数百个基因的表达，而一个基因的表达又可受数个转录因子的调控。转录因子的结构和功能缺陷，与人类的一些疾病（如肿瘤和炎症）相关，许多转录因子还是药物作用的靶点。所以，转录因子活性的检测对疾病的研究和药物开发都非常有意义。转录因子活性谱芯片是基于博奥独创的专利技术OATFA（Oligonucleotide Array-based Transcription Factor Assay）所开发的一种新型分析芯片。OATFA技术结合了凝胶滞留和DNA微阵列的优点，实现对转录因子蛋白的快速、高通量检测，可对细胞中上百种转录因子活性状况进行考察，给出细胞中某一时刻转录因子活性状况的全景图。
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博奥转录因子活性谱芯片样品接收单
产品特点
| ★ | 探针设计来源于商品化的TRANSFAC数据库（BIOBASE），采用模拟退火（Simulated Annealing）的优化算法，最大限度的排除了交叉结合和交叉杂交的可能性 |
| ★ | 点阵设计中加入了多种质控对照点，包括阳性对照和阴性对照，保证了实验结果的准确可靠 |
| ★ | 人源转录因子活性谱芯片共包括280条转录因子结合序列，可以同时检测270多种转录因子。与小鼠的同源性高达70％，与大鼠的同源性为40％；酵母转录因子活性谱芯片可以检测酵母全基因组规模的96种转录因子 |
| ★ | 优化的高保真单引物线性扩增的方法（SPA），在提高灵敏度的同时，严格遵守探针之间原有的定量关系 |
服务流程
★ 生物样品（组织或细胞）
★ 抽提核蛋白，蛋白浓度测定
★ 核蛋白与转录因子结合序列（Probe Mix）的混合物共同孵育
★ 分离回收与核蛋白中转录因子发生结合的Probes
★ 扩增并荧光标记
★ 芯片杂交
★ 芯片扫描
★ 数据分析
★ 数据保存和结果报告
服务优势
| ★ | 高通量：一次实验可以完成上百种转录因子的活性检测，可大大降低逐一检测的成本 |
| ★ | 高灵敏度：在标记过程中引入了扩增技术，使检测灵敏度有了显著的提高 |
| ★ | 准确：成对样本可以在同一张芯片上进行杂交分析，提高了检测结果的准确性 |
| ★ | 重复性好：由于采用了优化的实验流程和辅助工具，使实验结果的重复性R>0.95 |
| ★ | 严格的质控：为了保证实验结果的可靠性，芯片上设计了多种质控参照 |
| ★ | 强有力的文章支持：本芯片是由我们公司自主研发的服务平台，该技术的探索性文章（OATFA技术）就发表在Journal of Proteome Research（IF>6）上，后续的生物应用文章正在向更高质量的杂志投稿 |
| ★ | 专业的服务队伍：转录因子活性谱芯片技术服务的负责人就是该技术的创始人之一，对整个平台的细节及该技术的国际进展有很强的把握能力，提供技术服务的同时可以给予客户更深层次的建议 |
参考文献
· Shao, W., Wei, H., Qiao, J., Zhao, Y., Sun, Y., Zhou, Y. and Cheng, J. (2005)."Parallel profiling of active transcription factors using an oligonucleotide array-based transcription factor assay (OATFA)"Journal of Proteome Research, 4(4): 1451-1456. （链接文献）
发表文章
晶芯® 转录因子活性谱芯片：
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作者及文章题目
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合作单位
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期刊
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影响因子（2007）
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1
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Sun, Y., et al., Broad profiling of DNA-binding transcription factor activities improves regulatory network construction in adult mouse tissues. |
清华大学生物科学与技术系
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Journal of Proteome Research, 2008, 7(10): 4455-4464.（摘要链接）
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5.675
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2
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Qiao, J., et al., Novel high-throughput profiling of human transcription factors and its use for systematic pathway mapping. |
清华大学生物科学与技术系
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Journal of Proteome Research, 2008, 7(7): 2769-2779. （摘要链接）
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5.675
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3
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Zhao, Y., et al., Development of a novel oligonucleotide array-based transcription factor assay platform for genome-wide active transcription factor profiling in Saccharomyces cerevisiae. |
清华大学生物科学与技术系
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Journal of Proteome Research, 2008, 7(3): 1315-1325 （摘要链接）
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5.675
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4
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Shao, W., et al., Parallel profiling of active transcription factors using an oligonucleotide array-based transcription factor assay (OATFA). |
清华大学生物科学与技术系
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Journal of Proteome Research, 2005, 4(4): 1451-1456. （摘要链接）
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5.675
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订购信息
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产品编号
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服务名称
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转录因子数
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230010
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晶芯® 人转录因子活性谱芯片服务
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270
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230020
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晶芯® 酵母转录因子活性谱芯片服务
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96
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