代理科研服务

      Affymetrix公司全基因表达谱芯片覆盖物种广泛，在真核生物表达谱检测芯片方面产品种类最为齐全（在微生物芯片方面NimbleGen产品最齐全）。Affymetrix公司表达谱芯片设计独特，采用短探针（通常25mer长度），多位点设计（对一个基因转录本，设计多个探针，综合起来评价检测信号）；对于大部分表达谱检测芯片，采用PM-MM探针方案采集错配探针信号，进行检测背景校正。

      代谢动力学主要研究药物体内过程，即吸收（Absorption）、分布（Distribution）、代谢（Metabolism）及排泄（Excretion）过程，涉及众多药物相关蛋白的协同作用。对这些主要环节相关蛋白的基因型进行检测，有助于判断个体药物代谢反应情况。药物代谢酶和转运蛋白遗传检测芯片（Drug Metabolizing Enzymes and Transporter, DMET）是美国昂飞公司与十几家国际大药厂联合开发的，用于个体药物代谢基因型检测的芯片。在应用上，DMET芯片不但可以帮助个体用药安全性判断，更能在药物研发阶段分析药物代谢表型和基因型之间的关系以及变化情况来筛选药物候选物，从而有望开发出适合不同人群应用的高效安全药物。

简　介

      Affymetrix公司芯片生产采用有掩膜的光导合成化学技术，是目前最高密度的芯片制备技术。Affymetrix公司采用改进的长探针合成技术（约49mer），专门针对人类基因组序列变异检测推出了人类细胞遗传学全基因组2.7M芯片（Cytogenetics Whole-Genome 2.7M），在高分辨率下实现对人类基因组的检测。Cytogenetics 2.7M芯片是目前单张芯片最高分辨率的人类基因组CNV分析工具。芯片覆盖全基因组约270万个标记（探针间隔距离中位值为735bp），其中包括约40万个SNP位点，因此，该芯片不但可以实现拷贝数变异的高分辨率检测，发现微小缺失和扩增，还可以检测染色体中性杂合性缺失（copy neutral LOH）、单亲二体病（UPD）及嵌合现象。

芯片特点
    罗氏NimbleGen芯片产品具有高密度、长探针和芯片设计灵活的特点，表达谱芯片具有多方面优势

简　介
      罗氏NimbleGen设计的多种高分辨率基因芯片可以应用在ChIP-on-chip（染色质免疫沉淀）检测中，在染色体中确定特定DNA结合蛋白的准确结合位点，或者在一个基因组的任何感兴趣的区域内寻找染色体的结构改变。
 

简　介
     基因组DNA甲基化修饰是目前表现遗传学研究的重点内容。罗氏NimbleGen提供全基因组甲基化检测芯片、启动子甲基化芯片和定制的甲基化芯片。在检测上采用甲基化DNA免疫沉淀方法（Methylated DNA Immunoprecipitation, MeDIP），即使用甲基化胞嘧啶特异的抗体对甲基化DNA进行富集后，进行标记和杂交，该过程操作简便，可靠性高。罗氏NimbleGen丰富而多样化的产品为基础生物学以及肿瘤和其他疾病的表现遗传学机制研究，直至寻找大规模的甲基化表观遗传学标志物提供了高效的技术平台。
 

      对于疾病全基因组关联分析（genome wide association study， GWAS）发现的基因位点差异，通常都需要进行独立样本验证工作。这个阶段的工作特点是基因变异位点已经初步确定下来，数量通常为数十个到数百个；需要进行独立的大样本量确认，样本数量可能在数百到数千份。在这个阶段如果仍然使用全基因组高通量检测工具往往造成费用不可承受，而且，由于关注的变异位点已经初步确定，这样高通量检测往往并没有特别重大的价值。因此，选定一种适合少数位点、多个样品检测的工具是非常重要的。Sequenom质谱检测平台就非常适合这种应用场合。

MassARRAY^®EpiTYPER™ DNA 甲基化分析技术结合了碱基特异性酶切反应和 MALDI-TOF 检测原理用于DNA 甲基化定量分析。可实现多重 CpG 的分析检测，是用于 DNA 甲基化定量分析及在基因组任何区域或者候选基因中鉴定甲基化定量分析的首选方法。

      单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism, SNP）指基因组单个核苷酸的变异，它是最微小的变异单元，是由单个核苷酸对置换、颠换、插入或缺失所形成的变异形式。单核苷酸多态性是基因组上高密度的遗传标志。在人类基因组中，已发现的SNP数量超过1000万，但分布密度不等，一般在100bp到1000bp之间。
      作为第三代遗传标记，SNP数量众多、分布密集，易于检测，因而是理想的基因分型目标。SNP分型检测在疾病基因组（如疾病易感性），药物基因组（药效、药物代谢差异和不良反应）和群体进化等研究中具有重大意义。SNP分型技术大体为两类，一类是主要基于凝胶电泳的低通量检测，另一类是以芯片技术为代表的高通量检测。
     Affymetrix公司针对人类全基因组SNP检测推出多个版本检测芯片，2007年5月份，Affymetrix公司发布了人全基因组SNP 6.0芯片，包含90多万个用于单核苷酸多态性（SNP）检测探针和更多数量的用于拷贝数变化（CNV）检测的非多态性探针。因此这种芯片可检测超过180万个位点基因组序列变异，即可用于全基因组SNP分析，又可用于CNV分析，真正实现了一种芯片两种用途，方便研究者挖掘基因组序列变异信息。