2007年“系统化生物芯片和相关仪器设备的研制及应用”项目荣获国家技术发明奖二等奖；2018年“遗传性耳聋基因诊断芯片系统的研制及其应用”项目荣获国家技术发明奖二等奖；2013年“中药安全性关键技术研究与应用”项目荣获国家科学技术进步奖一等奖；2023年“中医体质辨识体系建立及应用”项目荣获国家科学技术进步奖二等奖；2025年“不良妊娠和出生缺陷的病因学机制及防控技术研发应用”项目荣获国家科学技术进步奖二等奖，彰显了博奥在中、西医领域科技创新方面的强劲实力。