健康科学研究院以药物研发为主线，将传统中医药与现代生命科学技术相结合，通过研究疾病机制，发现新的防治方法及药物，评估干预措施的有效性和安全性，进一步推广和应用研究成果等。健康科学研究院下设中药数据与资源部、中医药学部以及类器官芯片部，研究内容涵盖了中药物质库建设、信息管理、数据分析、高通量药物筛选、智善方研发、类器官研究和器官芯片开发等。

研究院承担和参与了26项国家和省部级科研项目。已发表SCI论文15篇，获得授权专利43项，申请专利69项（其中发明专利65项），获得软件著作权63项。